Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim15Q3UTD9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms