Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mindy4Q3UQI9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms