Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Elf3Q3UPW2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Elf3Q3UPW2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms