Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem253Q3UNB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Tmem253Q3UNB8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem253Q3UNB8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem253Q3UNB8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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