Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd27Q3UMR0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd27Q3UMR0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms