Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Washc4Q3UMB9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Washc4Q3UMB9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Washc4Q3UMB9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms