Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc33Q3ULW6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms