Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtcl1Q3UHU5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtcl1Q3UHU5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mtcl1Q3UHU5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms