Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Puf60Q3UEB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Puf60Q3UEB3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms