Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip13Q3UA06 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip13Q3UA06 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms