Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf180Q3U827 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf180Q3U827 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf180Q3U827 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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