Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U7U4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U7U4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U7U4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U7U4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms