Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VwceQ3U515 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms