Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim6Q3U0I6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim6Q3U0I6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms