Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hace1Q3U0D9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hace1Q3U0D9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hace1Q3U0D9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms