Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt1Q3TX08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trmt1Q3TX08 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt1Q3TX08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms