Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccndbp1Q3TVC7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccndbp1Q3TVC7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccndbp1Q3TVC7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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