Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdlim7Q3TJD7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdlim7Q3TJD7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms