Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc13Q3TIR1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc13Q3TIR1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms