Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eepd1Q3TGW2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eepd1Q3TGW2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms