Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc127Q3TC33 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc127Q3TC33 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms