Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prr27Q3SYJ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms