Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hddc2Q3SXD3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms