Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2N2

Spopl, Speckle-type POZ protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpoplQ2M2N2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpoplQ2M2N2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpoplQ2M2N2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpoplQ2M2N2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SpoplQ2M2N2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SpoplQ2M2N2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpoplQ2M2N2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpoplQ2M2N2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms