Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam178bQ24JP3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam178bQ24JP3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam178bQ24JP3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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