Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim71Q1PSW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim71Q1PSW8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms