Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lgQ1ERP8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd300lgQ1ERP8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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