Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam171bQ14CH0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam171bQ14CH0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms