Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpusd2Q149F1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpusd2Q149F1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms