Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gli2Q0VGT2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gli2Q0VGT2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gli2Q0VGT2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms