Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtel1Q0VGM9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtel1Q0VGM9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms