Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd12Q0VE29 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd12Q0VE29 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms