Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Vps8Q0P5W1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vps8Q0P5W1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms