Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cib3Q0P523 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cib3Q0P523 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cib3Q0P523 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cib3Q0P523 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib3Q0P523 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cib3Q0P523 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms