Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnnm1Q0GA42 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnnm1Q0GA42 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms