Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc7a1Q09143 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc7a1Q09143 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc7a1Q09143 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms