Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F13bQ07968 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F13bQ07968 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F13bQ07968 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F13bQ07968 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F13bQ07968 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms