Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f1Q07916 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou6f1Q07916 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f1Q07916 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms