Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a2Q07643 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a2Q07643 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a2Q07643 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms