Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Siah1bQ06985 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1bQ06985 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms