Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox13Q04891 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox13Q04891 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox13Q04891 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms