Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox8Q04886 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms