Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp1Q03401 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Crisp1Q03401 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms