Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs2Q03350 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thbs2Q03350 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms