Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfiaQ02780 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms