Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb4Q02738 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb4Q02738 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb4Q02738 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms