Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RykQ01887 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RykQ01887 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RykQ01887 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RykQ01887 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RykQ01887 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RykQ01887 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RykQ01887 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RykQ01887 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RykQ01887 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RykQ01887 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RykQ01887 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RykQ01887 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RykQ01887 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RykQ01887 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RykQ01887 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RykQ01887 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RykQ01887 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RykQ01887 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RykQ01887 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RykQ01887 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RykQ01887 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RykQ01887 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RykQ01887 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RykQ01887 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RykQ01887 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RykQ01887 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RykQ01887 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RykQ01887 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RykQ01887 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RykQ01887 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RykQ01887 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RykQ01887 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RykQ01887 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms