Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja5Q01231 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gja5Q01231 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms