Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb2Q00977 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb2Q00977 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms