Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbp1Q00915 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms